Тема курсовой работы  для 1- 2 студентов 1- 4 курсов ФББ МГУ        
                                            
Тьютор профессор/зав. лабораторией Любецкий Василий Александрович 

Институт проблем передачи информации РАН.
                                                                                                                                                                   
куратор из НИИ ФХБ или ФББ  внс В.В. Алешин.
как связаться: e-mail lyubetsk@iitp.ru, lyubetsk@mail.ru                                                                                                                                             		тел. 8-9104646917.
                                                                                                                                                                              .                         Тема работы: Массовый поиск классической аттенюаторной регуляции у бактерий

Характер работы (уточните; например: бионженерия; культуры клеток; анализ генома человека; программирование) 
‮ экспериментальная нет
‮ биоинформатика  в основном
‮ литературный отчасти обзор
Аннотация,  литература для введения в проблематику   
Один из механизмов регуляции активности генов бактерий на уровне мРНК использует так называемые аттенюаторы. Аттенюатор – это часть мРНК, способная к образованию альтернативных внутримолекулярных спиралей и шпилек, причем реализация одного из вариантов прерывает транскрипцию прежде, чем образуется полноценная мРНК. Выбор одного из этих вариантов зависит от концентрации аминокислоты. Аттенюатор позволяет быстро регулировать уровень транскрипции в зависимости от концентрации аминокислоты. Массовый поиск классической аттенюаторной регуляции далеко не завершен, хотя в этом направлении проведена большая работа и, в частности, нами разработаны специальные компьютерные  программы для такого поиска. Задача в том, чтобы провести широкий поиск потенциальных сайтов классической аттенюаторной регуляции по всей базе данных и провести анализ найденных сайтов, включая функциональную аннотацию соответствующих генов. 
Vitreschak A.G., Lyubetskaya E.V., Shirshin M.A., Gelfand M.S., Lyubetsky V.A. Attenuation regulation of amino acid biosynthetic operons in proteobacteria: comparative genomics analysis. FEMS Microbiol Letters, 2004 May 15; 234(2), p. 357-70.